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2009年に刊行した『絵でわかる人類の進化』に加筆修正した新書版。
序章（霊長類のゲノム研究／東南アジアの超小型原人／500年さかのぼった弥生時代のはじまり）
第1部 進化のしくみ
第１章 進化とは（人間観の変遷／博物学の時代／進化論の誕生／骨や歯を中心とした形態の進化／分子進化学の誕生と中立進化論／遺伝的浮動と自然淘汰）
第２章 進化の中心，ゲノムＤＮＡ（ＤＮＡが生物遺伝情報の担い手／ゲノムＤＮＡとは／ゲノムは進化する／ゲノム進化の例／人類進化と遺伝情報進化のかかわり／ゲノムに記述されている形態形成の情報と発現 ほか）
第３章 人類進化の年代を測る（ダーウィンの進化論と地球の年齢／天然の砂時計：放射性同位体／人類の歴史を測る／解剖学的現代人とネアンデルタール人／放射性炭素と加速器質量分析／弥生時代が古くなった？ ほか）
第４章 過去の環境変動をさぐる（人類の時代：第四紀／氷期・間氷期のサイクル：太陽の恩恵／氷河期という革命的なアイデア／酸素同位体による新しい指標／さまざまな古環境の記録／海水準面の変動／地球温暖化と人類のこれから）
第２部 人類のあゆみ
第5章 サルからヒトへ～猿人の登場（サルから進化したヒト／霊長類の進化／最初の人類はアフリカで誕生した／ヒト独特の特徴とその進化／最初の人類，猿人の誕生／猿人が歩いた証拠／複雑な猿人の系統進化 ほか）
第6章 原人の進化とユーラシアへの拡散（人類進化の４段階？／最初の原人ホモ・ハビリス／道具と肉食／狩猟をはじめた強い人類？／ホモ・エレクトスの発見／トゥルカナ・ボーイが教えるホモ・エレクトスの特徴 ほか）
第7章 旧人の出現とネアンデルタール人の謎（旧人とは／誤っていた一時代前の旧人像／旧人はアフリカで進化した／インドネシアには旧人はいなかった？／ヨーロッパのネアンデルタール人 ほか）
第8章 現生人類（ホモ・サピエンス）の起源（ホモ・サピエンスとは／ネアンデルタール人とクロマニョン人：連続か不連続か／多地域進化説／アフリカに関する疑問 ほか）
第9章 複雑化する文化～私たちホモ・サピエンスを理解する～（私たちにとっての文化／生物進化と文化的変化の違い／すべての起源はアフリカに？／文化の多様化の起源 ほか）
第10章 日本列島人の変遷（日本列島人の生きてきた時間と空間／日本列島人の成立に関する通説／骨形態の違いから推定された日本列島人類集団の系統関係／東ユーラシアにおける日本列島人の遺伝的位置／二重構造説）
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